Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp3Q91W36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp3Q91W36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp3Q91W36 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp3Q91W36 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms