Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp25Q8VIK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrnp25Q8VIK1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp25Q8VIK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp25Q8VIK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp25Q8VIK1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms