Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TraipQ8VIG6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TraipQ8VIG6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TraipQ8VIG6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TraipQ8VIG6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TraipQ8VIG6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TraipQ8VIG6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TraipQ8VIG6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms