Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc71Q8VEG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc71Q8VEG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc71Q8VEG0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc71Q8VEG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.2 ms