Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ1

Ptgr2, Prostaglandin reductase 2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgr2Q8VDQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptgr2Q8VDQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptgr2Q8VDQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptgr2Q8VDQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptgr2Q8VDQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms