Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh10Q8VCH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh10Q8VCH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh10Q8VCH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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