Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd300ldQ8VCH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd300ldQ8VCH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ldQ8VCH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd300ldQ8VCH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300ldQ8VCH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms