Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4cQ8VCD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm4cQ8VCD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4cQ8VCD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4cQ8VCD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms