Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc9Q8VC31 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc9Q8VC31 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc9Q8VC31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc9Q8VC31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms