Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clptm1Q8VBZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clptm1Q8VBZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clptm1Q8VBZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clptm1Q8VBZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms