Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc80Q8R2G6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc80Q8R2G6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc80Q8R2G6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc80Q8R2G6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc80Q8R2G6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms