Protein–RNA interactions for Protein: Q8R285

Vmn1r79, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r79Q8R285 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r79Q8R285 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r79Q8R285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r79Q8R285 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r79Q8R285 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms