Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd3Q8R1N4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nudcd3Q8R1N4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nudcd3Q8R1N4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd3Q8R1N4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd3Q8R1N4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms