Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpv3Q8K424 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpv3Q8K424 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpv3Q8K424 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms