Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Matr3Q8K310 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Matr3Q8K310 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Matr3Q8K310 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Matr3Q8K310 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Matr3Q8K310 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.2 ms