Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx52Q8K301 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx52Q8K301 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx52Q8K301 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ddx52Q8K301 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx52Q8K301 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx52Q8K301 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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