Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl47Q8K2Y7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl47Q8K2Y7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms