Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nek9Q8K1R7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nek9Q8K1R7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek9Q8K1R7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek9Q8K1R7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek9Q8K1R7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms