Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phldb2Q8K1N2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phldb2Q8K1N2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phldb2Q8K1N2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Phldb2Q8K1N2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phldb2Q8K1N2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms