Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ago4Q8CJF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ago4Q8CJF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ago4Q8CJF8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ago4Q8CJF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ago4Q8CJF8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms