Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Parp11Q8CFF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Parp11Q8CFF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Parp11Q8CFF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Parp11Q8CFF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms