Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc17Q8CE13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc17Q8CE13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc17Q8CE13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms