Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc73Q8CDM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ccdc73Q8CDM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Ccdc73Q8CDM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ccdc73Q8CDM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ccdc73Q8CDM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,2 ms