Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcpip1Q8CDG3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcpip1Q8CDG3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcpip1Q8CDG3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vcpip1Q8CDG3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms