Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps53Q8CCB4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps53Q8CCB4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps53Q8CCB4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps53Q8CCB4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps53Q8CCB4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms