Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB76

Zfp449, Zinc finger protein 449, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp449Q8CB76 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp449Q8CB76 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp449Q8CB76 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp449Q8CB76 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp449Q8CB76 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp449Q8CB76 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms