Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC106179Q8C9L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC106179Q8C9L1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC106179Q8C9L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC106179Q8C9L1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms