Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara3Q8C850 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scara3Q8C850 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara3Q8C850 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara3Q8C850 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scara3Q8C850 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms