Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa5Q8C7G5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Apoa5Q8C7G5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apoa5Q8C7G5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa5Q8C7G5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms