Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ClmnQ8C5W0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClmnQ8C5W0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClmnQ8C5W0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClmnQ8C5W0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClmnQ8C5W0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms