Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc113Q8C5T8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc113Q8C5T8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc113Q8C5T8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc113Q8C5T8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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