Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Ssuh2Q8C3L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ssuh2Q8C3L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21,07■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ssuh2Q8C3L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ssuh2Q8C3L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ssuh2Q8C3L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,3 ms