Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa22Q8C1N8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa22Q8C1N8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms