Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csgalnact2Q8C1F4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Csgalnact2Q8C1F4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csgalnact2Q8C1F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csgalnact2Q8C1F4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Csgalnact2Q8C1F4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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