Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub1Q8C0D0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trub1Q8C0D0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trub1Q8C0D0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trub1Q8C0D0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub1Q8C0D0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms