Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FarsaQ8C0C7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FarsaQ8C0C7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FarsaQ8C0C7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FarsaQ8C0C7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FarsaQ8C0C7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FarsaQ8C0C7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms