Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc18a2Q8BRU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc18a2Q8BRU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc18a2Q8BRU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc18a2Q8BRU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc18a2Q8BRU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc18a2Q8BRU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc18a2Q8BRU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a2Q8BRU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms