Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Usp54Q8BL06 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Usp54Q8BL06 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp54Q8BL06 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Usp54Q8BL06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Usp54Q8BL06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp54Q8BL06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp54Q8BL06 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms