Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc4Q8BKW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc4Q8BKW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc4Q8BKW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc4Q8BKW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms