Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcfc2Q8BKT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcfc2Q8BKT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcfc2Q8BKT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcfc2Q8BKT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcfc2Q8BKT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcfc2Q8BKT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms