Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp5Q8BKN5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubgcp5Q8BKN5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp5Q8BKN5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp5Q8BKN5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms