Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIA3

Mkx, Homeobox protein Mohawk, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkxQ8BIA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MkxQ8BIA3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MkxQ8BIA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MkxQ8BIA3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MkxQ8BIA3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 480.6 ms