Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Susd4Q8BH32 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Susd4Q8BH32 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Susd4Q8BH32 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Susd4Q8BH32 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Susd4Q8BH32 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms