Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG55

Gpr171, Probable G-protein coupled receptor 171, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr171Q8BG55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr171Q8BG55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr171Q8BG55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr171Q8BG55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpr171Q8BG55 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpr171Q8BG55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr171Q8BG55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr171Q8BG55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr171Q8BG55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr171Q8BG55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr171Q8BG55 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms