Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdspl2Q8BG15 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdspl2Q8BG15 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdspl2Q8BG15 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms