Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfascQ810U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfascQ810U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfascQ810U3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfascQ810U3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms