Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amigo1Q80ZD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Amigo1Q80ZD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Amigo1Q80ZD8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Amigo1Q80ZD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms