Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbed4Q80WQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed4Q80WQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed4Q80WQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed4Q80WQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed4Q80WQ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms