Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Abcc12Q80WJ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Abcc12Q80WJ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Abcc12Q80WJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Abcc12Q80WJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Abcc12Q80WJ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Abcc12Q80WJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms