Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgo2Q7TSY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sgo2Q7TSY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgo2Q7TSY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms